De Carmelinstellingen genieten een grote mate van autonomie; onderwijskundige keuzes en de zorg voor de onderwijskwaliteit worden op de scholen zelf gerealiseerd. Elke schoolleider is verantwoordelijk voor de resultaten van zijn/haar school, hierover legt de schoolleider periodiek verantwoording af aan het College van Bestuur, het bevoegd gezag. De taken en bevoegdheden van het College richten zich vooral op het initiëren en faciliteren van beleidsplannen en -projecten. Een Raad van Toezicht fungeert als toeziend orgaan; zij controleert het College van Bestuur.
De eindverantwoordelijke schoolleiders zijn verenigd in het Convent van Schoolleiders. Evenals de Gemeenschappelijke Medezeggenschapsraad adviseert het Convent het College van Bestuur over bovenschools beleid. Verder worden de scholen en het College van Bestuur ondersteund door de controller en medewerkers van het bestuursbureau, gevestigd in Hengelo (Ov).
De scholen van de Stichting hebben een eigen managementstructuur bestaande uit drie lagen: een centraal management, een locatiemanagement en teammanagement. Deze structuur past goed bij de wijze waarop de scholengemeenschappen zijn georganiseerd, namelijk gebouwelijk gespreid. Ook beantwoordt de structuur aan de opvattingen van Carmel over integraal schoolleiderschap. Op deze manier werken wij samen aan een breed en samenhangend onderwijsaanbod van hoge kwaliteit, in een sfeer van betrokkenheid en onderlinge verbondenheid.
De Carmelscholen staan centraal in de organisatie van Stichting Carmelcollege. Het solidaire verbond is in de afbeelding hieronder schematisch weergegeven.
